現代的用氣相色譜儀(*：澤銘）大都是即可做填充柱氣相色譜又可進行毛細管氣相色譜的色譜儀，在儀器設計上考慮了毛細管氣相色譜儀(*：澤銘）的特殊要求。毛細管氣相色譜儀的進樣系統和填充柱氣相色譜有較大的差別：

1 氣源和流量控制

這一部分的部件和填充柱色譜儀沒有太大的區別，只是由于毛細管氣相色譜要求的載氣流量比填充柱小得多，如不用分流進樣，則柱前壓較小，流量指示部件的樹脂也較低，對控制和檢測部件的要求高，所以早期的毛細管色譜多用分流進樣。目前的儀器多采用電子壓力控制系統。

2 進樣系統

毛細管氣相色譜儀的進樣系統和填充柱色譜儀有較大的差別，為了肯發毛細管氣相色譜在分流進樣中帶來的歧視現象，研究了多種進樣方法和設備，如分流/不分流進樣系統；保留間隙進樣系統；程序升溫進樣系統。

3 色譜柱系統

這一系統包括色譜柱柱箱，柱接頭和色譜柱。柱箱和填充柱色譜儀的沒有什么區別，柱接頭是連接進樣系統的，要比填充柱色譜復雜一些。

4 檢測系統

毛細管氣相色譜可使用各種檢測器，常用主要的是FID，也可以和微型TCD、ECD、FPD及TID相匹配。但是要和毛細管氣相色譜儀匹配，檢測器的死體積要盡可能的小。

5 記錄和數據處理系統

毛細管氣相色譜的出峰時間短，有時候不到1s，因為毛細管氣相色譜的柱效高，峰形尖銳，區域寬度小，出峰時間有時很快，所以記錄儀的響應隨度要快。